中醫科涵蓋內外婦兒常見病、多發病治療，同時針對亞健康人群體質調養的民族醫中醫科。開設民族醫中醫專家門診、民族醫中醫特色治療室、民族醫中醫住院病房等。
科室團隊由著名苗醫、侗醫及本院專家組成，其中主任醫師2人，中醫內科副主任醫師3人，主治醫師4人，含中醫內科碩士研究生1人。聘請的5位省內外民族醫、名中醫長期坐診。
苗族創造了本民族豐富多彩的文化，其中的醫藥文化以天然綠色、方法奇特、簡練實用和療效確切而著稱，又因同時具有文化價值、實用價值和經濟價值而成為最具魅力的文化之一。苗醫藥也是我國民族醫藥中的一朵奇葩，被譽為“大山深處的瑰寶”。苗族醫藥是擁有自身理論指導的醫學體系，包含了本民族的基本觀念、思維方式、哲學思想、民族習慣、經驗積累和特殊發現等，其總結的醫藥理論是指導用藥的綱要。如“兩綱兩病理論”“苗醫生成哲學”“五基成物學說”“三界九架理論”“交環理論”“四大筋脈理論”“苗藥質征理論”等，無不是長期實踐積累的升華和無數醫學發現的結晶。
侗族醫藥起源于侗族人民長期的生產和生活實踐，是在特定自然環境和歷史文化背景下同自然界和疾病作斗爭的產物。由于侗族本身無本民族文字和史實的記載，侗族醫藥的起源、形成和發展雖然無古籍可考，但從侗族民間長久流傳的古歌、巫詞、諺語、傳說和民間侗醫的醫藥記錄中，仍可窺知其大概。侗醫對疾病的病因、病機、診斷、用藥，藥物的命名、加工炮制、養生保健都有獨具特色的方式方法，創造了許多簡、便、廉、效的治療方法，對侗醫理論的探討、對侗藥的進一步研究，從中發現、挖掘、開發出效高、價廉的民族藥品，具有重大現實的醫藥學價值。
科室根據患者的病情及身體狀況，選擇適合病人的治療方案，用苗醫苗藥、侗醫侗藥、中醫中藥，扶正祛邪，調節病人的身體機能，提高其生活質量；運用中醫中藥、民族醫藥內服外用、針灸治療等減輕患者臨床癥狀；同時還根據中醫循經治療的原則，運用多源循經傳導腫瘤治療儀、中醫定向透藥儀、為腫瘤晚期患者止痛、提高機體免疫機能等對癥支持治療。
